异地运营结构和主体选择，可以有三种模式：子公司、分公司和项目部。实务中三种模式都有见到，但每种选择的财税风险和特点显然大有不同，企业在自身经营中如何进行选择？
一、设立手续差异
三种模式中，项目部Zui简单，无需在经营地设立机构，不存在工商登记手续，直接由总部派驻人员组成班子即可，但通常为了税收征管的便利，需要在公司所在地税务机关办理“外管证”，到经营地税务机关报验登记。房地产和建安企业项目部就属于这种情况。当然，因为是项目部，一切经营活动开展都以公司名义进行，包括合同的签署，业务的开展，款项的收取等。那么，项目部不需要单独建账，也不是独立的会计主体和纳税主体。
分公司不是独立的法律主体，但仍需要在经营地工商部门办理登记注册手续，只是手续较之正常公司简单许多，无需实收资本，由总部出资设立即可。还需办理税务登记，绝大多数分公司属于独立经营，独立核算的会计主体。只有极少数分公司属于非独立核算性质，在财税上同项目部雷同，在次不作考虑。
子公司一般由母公司控股，但依然是一个在法律上完全独立的公司，要经历完整的工商登记和税务登记手续。作为独立的法律主体，子公司也是独立核算会计主体，同样是独立纳税的纳税主体。
二、如何纳税差异
项目部不是独立的会计主体和纳税主体，始终以企业名义经营，自身不涉及单独交税问题。
分公司不是法律主体，但通常也独立从事经营活动，是独立的会计主体，需要在经营地税务机关缴纳增值税，属于增值税纳税主体。所得税由于按照税法规定是整个企业总分机构统一计算，总分机构应作为一个所得税纳税主体，实务中如果总部和分支机构跨省，则应该统一计算所得税，两边按照一定比例分头缴纳；如果总部和分支机构在一个省，按照本省规定处理，但通常是回到总部统一缴纳。但无论分头缴纳还是统一缴纳，均是作为一个纳税主体统一计算所得税。
子公司是独立的法律主体，独立从事经营活动，也是独立的会计主体和完全独立的纳税主体，单独在经营注册地税务机关缴纳增值税和所得税。在增值税上，分公司和子公司是一样的，但在所得税上两者完全不同，那就意味着子公司当期的亏损只能自行弥补，而分公司当期亏损可以在总部合并弥补，这是二者税上的差异。
各地政府针对子公司可能有很多招商优惠和税收优惠政策，而分公司由于主体不完全独立，一般无法享受这些优惠政策。
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很多行业都接受政府监管，特殊经营zizhi的审查和取得就是监管的Zui常见类型。房地产、建安行业正式经营zizhi审批的典型。
每一个新设的房地产公司和建筑公司都必须取得相对应zizhi方可开展合法的经营活动，那么子公司必须重新取得zizhi，不可使用母公司（大股东）的经营zizhi。分公司由于不是独立法律主体，直接使用总部企业zizhi即可。项目部本来就类似于企业的一个外派部门，更不存在独立zizhi问题。zizhi的高低，在某些行业是竞争力的集中表现，如建筑行业，我们不难发现，建筑行业基本上没有设立子公司，全部是以分公司和项目部模式运作，根本原因正在于此。
四、风险考量差异
异地经营，从空间上独立在外，控制力随之减弱，经营风险必然增加。风险一旦爆发，必然对原有主体进行冲击。三种模式在风险考量上也各有不同，项目部和分公司都不是独立法律主体，它们同总部之间的风险关系是无限责任，如果项目部和分公司出现经营风险和债务风险，总部必须承担全部责任。子公司作为独立法律主体，有自己独立的法人财产，承担独立的民事责任和民事义务，如果遇到经营风险，只需要就自身法人财产承担有限责任即可。
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项目部和分公司不是独立法律主体，不能独立对外融资，必须在总部公司平台上方可取得资金。而子公司作为独立法律主体，也同样是独立的融资平台，可自行同金融机构和投资机构合作融资。
六、灵活机动差异
任何企业经营中对未来的判断都不可能完全准确，很多时候我们的决策需要给未来留一点变化的余地。在围棋中就讲究不要将变化走尽，万一将来形式发生转变，已经没有选择岂不可惜。
以房地产公司为例，常常会在拿到土地之后甚至是项目实施一段时间后改变经营意图，从自己开发调整为合作开发或者将项目zhuanrang，如果是项目部和分公司模式，这种合作和zhuanrang就相对比较艰难，或者要承担更多的风险，因为原总公司平台涉及其他项目和经营活动，项目部和分公司又无法作为独立平台和主体，重新将土地和项目分拆必然涉及较重的税负和较多的政策限制，很多企业就是因为这种原因导致合作或zhuanrang搁浅。
如果是单独设立的异地项目子公司，问题就变得很简单。子公司的独立平台无论是对于新股东的加入还是股权的全部zhuanrang都变得比较容易，在这种股权的变化中，Zui多涉及所得税风险，土地和项目所有权在法律上未发生变化，也不会受到相关政策限制。
决策要素 | 项目部 | 分公司 | 子公司 |
设立手续 | 简单 | 相对简单 | 复杂 |
如何纳税 | 合并纳税 | 部分合并 | 完全独立 |
zizhi限制 | 无需独立zizhi | 无需独立zizhi | 独立zizhi |
风险考量 | 无限责任 | 无限责任 | 有限责任 |
融资便利 | 不能独立融资 | 不能独立融资 | 独立融资 |
灵活机动 | 不灵活 | 不灵活 | 灵活 |
异地经营决策要素汇总表