检查企业的合同内容，核对实际经营范围和需求，查看是否存在异常交易或者虚假合同。
二、查发票
确保发票与企业的经营范围相符，是日常经营所需，并且不存在虚开发票的情况。特别提醒要注意发票、业务、资金、物流四流一致,提供一条完整真实的证据链,否则还是有可能会被认定存在问题。
三、上下游相关情况
查询上下游的账簿，查看购买方和销售方针对同一笔交易入账的经济业务内容是否一致。
四、资金流方面
以结算方式为出发点，查询银行卡及现金的流向是否存在无真实资金流，或者资金流异常回流，以及双方的资金流不一致的情况。
五、收入方面
审查企业销售情况，确保销售收入的真实性和完整性，查看是否所有应税收入都已申报纳税。例如会检查是否存在该确认为收入却没有入账的情况，特别是往来款项是否存在应计未计收入的问题。还会通过大数据查询与交易的下游企业相关账本数据比对是否存在异常，以及比对同行业收入，稽查是否存在异常等方式来核查企业收入情况。
六、成本和费用方面
关注成本和费用报告是否合理，是否存在虚列成本或费用的情况，以及是否有不合规的费用抵扣。比如会查看成本结转与收入是否相匹配，是否存在多结转的情况；计提项目是否符合规定；长期购进原材料或商品时暂估入库、购进原材料或商品为了价格低一点而不索要发票、计提了费用而迟迟没有费用发票、差旅费加油费会议费等费用异常等情况也会被重点关注。
七、企业库存方面（在金税三期及金税四期背景下）
企业进多少货，出多少货，还剩多少货变得更加透明，如果库存账实不一致，企业会被重点关注，企业务必引起重视，及时查找原因。
八、企业银行账户方面
关注企业当期新增应收账款大于收入80%、应收账款长期为负数、当期新增应付账款大于收入80%、预收账款减少但未记入收入、预收账款占销售收入20%以上、当期新增其他应收款大于销售收入80%等情况。
九、纳税人的账簿、记账凭证、报表及相关资料
审查这些文件的真实性和完整性。
十、扣缴义务人代扣代缴、代收代缴税款情况
检查相关账簿和记录。
十一、生产、经营场所及货物存放地
实地考察以验证企业的运营状况。
十二、应纳税的商品、货物或其他财产
检查是否有未申报的应税物品。
十三、与纳税或者代扣代缴、代收代缴税款有关的情况
向第三方调查了解相关信息。
企业被税务局查账的原因通常包括但不限于随机抽查、接到举报、数据分析发现异常（如税负率显著变化）、上下游关联企业被查，或是享受税收优惠政策的企业成为重点对象等。
如果企业涉及虚开发票、逃税漏税、骗取出口退税、虚报出口、违规公转私行为、税负率异常（特别是远低于平均税负率）、享受税收优惠政策等情况，也会成为税务稽查重点对象。
