有机肥的种类： 农家肥：堆肥，沼渣等。 商品生物有机肥：商品化生产的生物有机肥。即农家肥商品化生产后的产物。有机肥加微生物菌剂，每克含菌大于500万功能菌。 生物有机肥与化肥相比：
1)生物有机肥营养元素齐全;化肥营养元素只有一种或几种。
2)生物有机肥能够改良土壤;化肥经常使用会造成土壤板结。
3)生物有机肥能提高产品品质;化肥施用过多导致产品品质低劣。
4)生物有机肥能改善作物根际微生物群，提高植物的抗病虫能力;化肥则是作物微生物群体单一，生病虫害。
5)生物有机肥能促进化肥的利用，提高化肥利用率;化肥单独使用易造成养分的固定和流失。
在我国，生物有机肥登记检测标准为农业部颁发的强制标准 NY 884-2012《生物有机肥》。
NY884-2012规定的生物有机肥料检测项目有有效活菌数、有机质含量、水分、pH值、粪大肠菌群数、蛔虫卵死亡率、有效期等技术指标。
而重金属含量限定检测项目主要为总砷、总镉、总铬、总铅、总汞五种。除此之外，生物有机肥使用的菌种也需要通过安全性评价检测，具体检测方法可以依据NY1109来出具报告。