京东集采店铺的清退流程可以归纳为以下几个步骤：
1.**警告通知**：当店铺存在违规行为或未达到平台要求时，京东会通过站内信或其他方式向店铺发送警告通知，明确指出店铺存在的问题，并要求店铺在规定时间内进行整改。
2.**整改期限**：商家在收到警告通知后，需要根据京东的要求，在规定时间内完成整改，并向京东提交整改材料以证明其已经解决了存在的问题。
3.**审核评估**：京东会对店铺提交的整改材料进行审核评估，判断店铺是否符合继续合作的要求。这一步骤是为了确保店铺已经改正了问题，并符合京东的平台标准。
4.**清退决定**：根据审核评估的结果，京东会做出是否清退的决定。如果店铺整改不合格或者违规行为严重，京东有权终止与该店铺的合作，即执行清退。
5.**清退执行**：一旦决定清退，京东会按照相关流程执行清退操作，包括但不限于关闭店铺、下架商品、冻结资金账户等。京东会向商家明确清退的具体原因和后续操作指南。
请注意，被清退的店铺在一定条件下是有可能重新开店的，但具体情况需要根据清退的原因和店铺的整改情况来确定。如果商家能够认真整改并符合京东的平台要求，京东可能会考虑重新开放店铺。如果店铺因为严重违规行为（如出售假货、水货等）被清退，则可能面临保证金被全额扣除等更严重的后果。
如果是商家主动申请退店，流程会有所不同，主要步骤包括后台申请、信息核对、签署终止协议等。完成这些步骤后，商家需要等待京东的审核结果，审核通过后即可完成退店操作。在退店过程中，商家需要确保已经履行完毕所有的交易保障义务，如发货、退换货、维权投诉处理等。
