1.所谓分公司的独立核算，即分公司的收支由分公司单独核算，简单讲就是分公司盈亏自负。独立核算分公司要单独出具财务报表。非独立核算就不用了，要到总公司核算。不论是否是独立核算，都要求单独建账。
2.如果分公司满足如下条件，一般就是独立核算：有权独立开展营业活动、签合同、开发票、开基本户(一般户没问题)。反之就是非独立核算。
3.独立核算与非独立核算，是会计上的定义，税法上没有这个概念。税法上主要看是否是经营性分公司。如果是经营性分公司，一般而言，就地缴纳企业所得税和增值税。如果是非经营性分公司，一般而言，增值税只需要就地做增值税零申报(有的地方不要求做申报)，所得税就不用当地做分摊了。
4.独立核算和经营性分公司没有对等关系，但是，经营性分公司一般都是独立核算，就地缴纳增值税和分摊所得税，非经营性分公司一般是非独立核算，不用就地纳税。【57号文规定，如果是不具有生产经营职能(只从事售后服务、内部研发、仓储)，当地不交增值税的分公司，不就地分摊所得税。】
5.但是税务局依然可以认定你的非独立核算分公司为经营性分公司，进而要求就地纳税。因为，如前所述，是否独立核算是你说了算，但是是否是经营性是税务局结合你的营业范围和实际业务来判定。
6.不管是不是经营性分公司，都需要做税务登记。税种核定的时候，有些地方基于你的经营范围会给你核定各个税种。如果核定了，你就需要做申报。没有业务的话，你就每个月或者季度做零申报。也有的地方不要求。
7.无论是否是经营性分公司，增值税都是做就地申报，所得税都是做汇总申报。区别在于，如果是非经营性分公司，增值税只是零申报，所得税不需要做当地的分配。
****
根据《国家税务总局关于印发
以下二级分支机构不就地分摊缴纳企业所得税：
(一)不具有主体生产经营职能，且在当地不缴纳增值税、营业税的产品售后服务、内部研发、仓储等汇总纳税企业内部辅助性的二级分支机构，不就地分摊缴纳企业所得税。
(二)上年度认定为小型微利企业的，其二级分支机构不就地分摊缴纳企业所得税。
(三)新设立的二级分支机构，设立当年不就地分摊缴纳企业所得税。
(四)当年撤销的二级分支机构，自办理注销税务登记之日所属企业所得税预缴期间起，不就地分摊缴纳企业所得税。
(五)汇总纳税企业在中国境外设立的不具有法人资格的二级分支机构，不就地分摊缴纳企业所得税。
