在杭州进行商业特许经营备案时，需要特别关注以下几个注意事项：
1、了解备案法规与要求：在申请前，深入了解《商业特许经营管理条例》及杭州市的相关规定，确保自己的经营模式、合同内容、信息披露等方面符合法规要求。
2、准备完整的申请材料：根据杭州市商务主管部门的要求，准备完整的申请材料，包括但不限于商业特许经营备案申请书、商业特许经营合同样本、商标注册证书、企业法人营业执照等。确保材料的真实性和完整性，避免因材料不全或虚假导致备案失败。
3、注意合同规范与履行：特许经营合同是备案的核心内容之一，应确保合同内容规范、合法，并明确双方的权利和义务。在备案后，双方应切实履行合同内容，避免发生纠纷。
4、关注备案进度与反馈：在提交备案申请后，密切关注备案进度，并根据商务主管部门的反馈及时补充或修改材料。保持与商务主管部门的沟通，以便及时了解备案结果。
5、遵守市场规则与商业道德：在招商加盟过程中，应遵守市场规则和商业道德，不得进行虚假宣传、误导消费者等不正当行为。应保护加盟商的合法权益，为加盟商提供必要的支持和指导。
6、及时更新备案信息：在备案成功后，如发生品牌信息、业务变更等内容，应及时向商务主管部门更新备案信息，确保备案的有效性和商业特许经营的运营质量。
杭州商业特许经营备案是一个需要谨慎对待的过程。通过了解法规要求、准备完整材料、关注合同规范与履行、关注备案进度与反馈、遵守市场规则与商业道德以及及时更新备案信息等措施，可以确保备案的顺利进行并为后续的招商加盟活动奠定坚实的基础。